遗忘方舟的六个灵分布在不同的地图区域，每个灵都有独特的颜色和获取方式。念之灵会散发出红色光芒，位于墓土沉船图后方广阔的农田区域，从方舟出发向沉船尾部飞行大约20秒后就可以发现。水之灵是蓝色的状态，需要在霞谷溜冰场反复的进行搜查，如果冰面上没有踪迹就要潜入冰层下的湖底寻找，水之灵会定时的在上下层切换位置。风之灵是青色的，进入云野地图后立即转身朝着晨岛方向的云层飞行，可以看到它在云雾中不停的穿梭。

地之灵是六个灵中最难收集的，它会发出绿色的光芒，地之灵位于云野右边隐藏图中的浮岛位置。需要登上最左侧的矮小浮岛等待它出现，最好的捕捉时机是游戏内时间整点的前后，有时它还会被天空的鲲带着盘旋，这个时候等待的时间可能需要十分钟。心之灵是一个紫色的光球，它隐藏在禁阁一层的双人门内。这个门必须两名玩家同时开启石门才能进入，在通道尽头的石墙缝隙处可以找到它。最后的火之灵是橙色的，它会在雨林终点前的水母图高空不停的来回穿梭，有时还会站在倒塌的树干或双层凉亭处仰头观察，会随时间推移慢慢降低移动高度。

收集的时候建议携带充能道具，比如烟花杖，特别是在需要长时间等待的地之灵和火之灵点位。双人门任务时要提前约好搭档，或者使用小号去卡门。所有灵在靠近时会发出对应颜色的微光并有特殊音效，戴上耳机会更容易定位。完成任务后记得返回方舟与向导先祖对话，每次提交都会解锁新的方舟地貌变化，最终阶段就可以见证到破败的方舟重现生机了。